近日，課題組采用羅氏454測序平臺，分別完成了堿、淡水雅羅魚的鰓、腎組織的轉(zhuǎn)錄組表達(dá)差異測序研究。
測序共得到1,826,022條序列，其中有效序列1,683,616條，平均長度298bp。序列經(jīng)Newbler軟件拼接得到30,606個contigs，平均長度為1,022bp。蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫比對發(fā)現(xiàn)，19,196個contigs具有明確的生物學(xué)功能，與斑馬魚匹配的同源蛋白多達(dá)16，000條；數(shù)字差異表達(dá)譜分析顯示，共有2247個基因在鰓、腎組織中發(fā)生顯著變化，其中上調(diào)基因1049個，下調(diào)基因1198個。
目前測序數(shù)據(jù)的初步分析、整理工作已接近尾聲，數(shù)據(jù)深度挖掘工作正在有序進(jìn)行中。該項目的開展對揭示魚類耐鹽堿機(jī)理、培育性狀優(yōu)良的耐鹽堿新品種，具有十分重要的科學(xué)意義。