智利國家漁業和水產養殖部門已經樹立目標減少三文魚飼養操作中抗生素的使用量。
     智利國家漁業和水產養殖部門的新任經理 José Miguel Burgos 說智利將盡量減少三文魚養殖過程中抗生素的使用，以消除智利和挪威三文魚飼養農民之間的差距。
      智利國家漁業和水產養殖部門估計，與挪威要求的在飼養過程中使用972千克的抗生素相比，智利使用了大約450700千克的抗生素。
      Burgos 說：“與北半球不同，我們的健康問題是與細菌問題有關的問題，并不是病毒性的。”
      智利大量使用抗生素反映了該國與生物挑戰的斗爭，幾年前智利農場遭受傳染性三文魚貧血。
     海虱還有鮭魚立克次體綜合癥都是對鱒魚養殖的最大挑戰，2014年第一季由于高死亡率的原因，三家生產公司宣布中止所有鱒魚產品的生產。
       這些挑戰對生產商的成本和利潤都造成了影響。
       耕海漁業公司自己抗生素使用量的圖表（見下圖）表明，挪威和智利抗生素使用量的巨大不平衡性，盡管2011年后抗生素使用量減少了。

耕海漁業公司自己抗生素使用量的圖表