中國水產科學研究院黑龍江水產研究所（以下簡稱“黑龍江水產研究所”）是我國成立最早、北方地區唯一的國家級淡水水產科研機構，創建于1950年6月，時名“東北人民政府農林部哈爾濱水產試驗場”；1958年10月劃歸黑龍江省，更名為“黑龍江省水產科學研究所”；1978年11月上劃，改稱“國家水產總局黑龍江水產研究所”；1982年10月隸屬現農業農村部中國水產科學研究院，更名為“中國水產科學研究院黑龍江水產研究所”。現址坐落于黑龍江省哈爾濱市道里區松發街43號。
黑龍江水產研究所立足黑龍江流域、三北地區和全國冷水資源分布區，面向世界科技前沿、國家重大需求和經濟主戰場，圍繞漁業科技創新和漁業產業高質量發展開展淡水漁業特別是冷水性魚類的公益性、基礎性研究和應用技術研發，著力解決漁業發展中關鍵重大科技問題，為我國漁業技術進步和產業發展提供支撐。
黑龍江水產研究所主要從事淡水漁業種質與遺傳研究、資源調查與養護研究、生態環境調查與修復研究、養殖動物新品種培育研究、養殖與防疫技術研究、水產品質量與安全監測研究、漁業生產突發問題應急攻關研究，開展水產技術成果轉化、技術示范與培訓以及出版水產科技雙月期刊《水產學雜志》。
黑龍江水產研究所目前已經建立起水產養殖技術、遺傳育種與種質資源、水產生物技術、漁業資源保護與利用、漁業生態環境與水產品質量安全等8大研究領域23個專業研究方向的學科體系，為我國寒冷地區漁業的可持續發展提供技術保障，并在全國冷水性魚類研究領域處于引領地位。建有國家級實驗室2個，國家級觀測實驗站1個，國家級聯盟1個，部級重點實驗室1個，部級科學觀測實驗站1個，部級研究中心1個；省級實驗室3個，省級研究中心1個，院級重點實驗室1個，院級研究中心1個，博士后工作站1個。下設渤海冷水性魚試驗站（黑龍江省牡丹江市）、呼蘭水產試驗場（黑龍省哈爾濱市）和寬甸水產試驗站（遼寧省丹東市）3個科研實驗及中試基地。擁有國內外先進的科學儀品設備80余臺（套），總資產近億元。
黑龍江水產研究所現有在職職工為141人,其中高級職稱51人，博士42人，院百名英才培育計劃10人，院青年拔尖人才1名，院創新團隊6支，黑龍江省級領軍人才梯隊1個。
黑龍江水產研究所內設機構15個，包括辦公室、黨委辦公室（監察審計處）、人事處、科研處、成果轉化處、財務處、基建與資產處7個職能管理部門；水產遺傳育種與生物技術研究室、水產養殖研究室、水產病害與防治研究室、魚類營養與飼料研究室、漁業資源研究室、漁業生態環境研究室、水產品質量安全與標準研究室和漁業信息技術發展戰略研究室8個科研業務部門。
黑龍江水產研究所先后與中國農業科學院、上海海洋大學（原上海水產大學)、大連海洋大學（原大連水產學院）、南京農業大學、浙江海洋大學、哈爾濱師范大學、天津農學院等高等院校建立了聯合培養碩士研究生點，現有研究生聯培導師24名，其中博士生導師2名。
黑龍江水產研究所先后與美國、俄羅斯、芬蘭、白俄羅斯、立陶宛、日本、韓國、蒙古、臺灣等40多個國家和地區的相關機構建立了科技合作關系。
“十二五”以來，黑龍江水產研究所承擔國家“863”、“973”、國家自然科學基金、國家科技支撐計劃、“948”、農業行業專項、農業財政專項、產業技術體系、省級各類項目653項，合同總經費約3.1億元。發表論文897篇，其中SCI（含EI）收錄228篇；出版專著17部；申請專利338項（其中發明專利123項），獲得授權專利312項（其中發明專利82項）；培育優良新品種3個：松浦紅鏡鯉、易捕鯉、鱘龍1號；發布國家標準2項，行業標準3項；獲得軟件著作權23項。獲得各級科技成果獎勵44項，國家科技進步獎1項，省部級獎勵15項。其中，繼“十一五”“鱘魚繁育及養殖產業化技術與應用”獲國家科技進步二等獎之后，2015年，“鯉優良品種選育技術與產業化”成果再獲國家科技進步二等獎。
黑龍江水產研究所致力于黑龍江流域漁業資源與環境保護工作，除開展漁業資源與環境調查、土著魚類增值放流與評價、大麻哈魚產卵場修復、種質資源開發利用等研究外，還為水資源保護規劃、水利工程環境評價等領域提供技術支持，以支撐產業發展和服務漁民為目標，致力于參加“一帶一路”建設，開展所、地、企合作，將產業需求的養殖技術以及新品種推廣到全國主產區，取得巨大的經濟和社會效益。積極開展科技扶貧，通過輸送人才、開展送科技下鄉、專題講座與技術培訓、贈送魚苗、現場指導、接納科技骨干來所學習與實踐等方式支援新疆、西藏、甘肅、內蒙古、四川等地的漁業發展，發揮了顯著的科技支撐作用。
70年來，黑龍江水產研究所以“求是、創新、開放、和諧”為辦所方針，按照“突出特色，保持優勢，抓住機遇，加快發展”的總體思路，積極推進現代科研院所機制建設，不斷提升科技創新能力和支撐產業發展，向著建設“國際一流，國內領先”水產科研機構的目標而努力奮斗！
